省农科院科研团队填补该物种基因组资源空白

近日，福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所科研团队，联合相关科研与技术推广单位，首次完成大黄鱼锥体虫染色体水平、无缺口参考基因组组装，填补了该物种基因组资源空白。相关成果已发表于国际期刊《Scientific Data》。

大黄鱼锥体虫，顾名思义，是一种以大黄鱼为主要感染对象的寄生虫，能够引发大黄鱼锥体虫病。病鱼通常出现贫血、鳃色苍白、脾脏肿大、体表出血、溃疡等症状，严重时致死。近年来，福建等大黄鱼主产区深受其害，发病率居高不下。

面对这一行业“克星”，过去的研究局限于形态学、少数分子标记以及系统发育分析，制约了对于其致病机制、宿主适应、进化规律等的深入了解。只有全面破译大黄鱼锥体虫的“遗传密码”，才能知己知彼，科学开展病害诊断与管理。

为此，研究团队采用现代基因组解析技术，对大黄鱼锥体虫开展全基因组测序和组装，最终获得了一个总长度约51.04Mb的高质量参考基因组，并将其组装为35条拟染色体。简而言之，就是不仅获得了海量的基因序列，还厘清了它们在不同染色体上的排布关系，实现了不同序列之间无缺口组装。

依托这套高质量参考基因组，大黄鱼锥体虫的神秘面纱逐渐被揭开。

研究团队进一步开展比较基因组分析，明确了大黄鱼锥体虫在锥体虫属中的系统进化位置，并发现515个基因家族发生扩张。所谓基因扩张，即一个物种在漫长演化中，不断复制出同类基因，并发生了突变。这些突变基因很可能赋予了大黄鱼锥体虫某些“超能力”，使其更容易感染宿主，躲过大黄鱼免疫系统的攻击。

研究团队发现，大黄鱼锥体虫基因组中的相关扩张基因，确实在宿主-病原互作、免疫逃逸、代谢调控、细胞信号等通路中呈现富集趋势。也就是说，这些突变基因很可能就是大黄鱼染病的背后元凶。这为后续深入解析大黄鱼锥体虫致病机制等关键问题，提供了重要线索。

“该研究实现了大黄鱼锥体虫研究从‘病原识别’向‘全基因组解析’的重要跨越。”论文通讯作者、福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所研究员罗土炎介绍，大黄鱼锥体虫首个高质量参考基因组的建立，为后续筛选特异性诊断标志物、解析宿主-寄生虫互作机制、追踪病原进化与传播，以及开展大黄鱼锥体虫病精准监测、风险评估和防控技术研发提供了重要基础数据，对保障大黄鱼养殖产业健康发展具有重要意义。

（福建日报记者 张辉）

来源：福建日报

责任编辑：蔡秀明 黄丽红